Analiza genetyczna dziedzicznej predyspozycji do raka okrężnicy w rodzinie ze zmienną liczbą polipów gruczolakowatych ad

Nasze początkowe podejście do badań klinicznych polegało na zbadaniu każdego pacjenta za pomocą 60-cm elastycznego proctosigmoidoskopu (Olympus CF P10S), a następnie pełnej kolonoskopii z endoskopem włóknistym (Olympus CF 1T10L), jeśli obecne były polipy dystalne. Jednakże, ponieważ rodzinne ryzyko raka okrężnicy w rodzinie stało się bardziej docenione, pełna kolonoskopia została wykorzystana do badania niektórych dorosłych członków rodziny. Te procedury diagnostyczne zostały wykonane przed lub bez znajomości charakterystyki genotypowej i analizy genetycznej opisanej poniżej. W przypadku badań genetycznych odnotowano wyniki badań górnego odcinka przewodu pokarmowego, jeśli były dostępne, chociaż systematyczne badania żołądka i dwunastnicy nie były wymagane w badaniu. Patologiczne doniesienia o poważnych i mikroskopowych odkryciach zostały przeanalizowane przez University of Utah Medical Center przez jednego z autorów, którzy również przejrzeli slajdy histologiczne uzyskane dla kilku uczestników, którzy nie byli badani w żadnym z ośrodków medycznych. Informacje kliniczne dotyczące zmarłych członków wczesnych pokoleń krewnych uzyskano z dokumentacji medycznej lub z aktów zgonu. Badania okulistyczne wybranych członków rodziny, ze szczególnym uwzględnieniem możliwości hiperplazji w nabłonku barwnikowym siatkówki, przeprowadzono w Klinice Okulistyki w Centrum Medycznym Uniwersytetu Utah. Markery DNA
Siedem polimorficznych markerów DNA użytych do testowania połączenia z locus APC w pokrewnych opisano w poprzednich badaniach mapowania: pC11p11, który pierwotnie umiejscowił gen do chromosomu 5q, 4, 5 i sześć dodatkowych markerów, które tworzą połączenie o wysokiej rozdzielczości mapa regionu zawierającego defekt lub wady APC.6 Cztery z markerów były haplotypowane podczas analizy osobników, ponieważ każdy z tych markerów ujawnił dwa oddzielne polimorfizmy miejsca. Dwa z tych polimorfizmów były nowe: polimorfizm MspI dla sondy cYN5.48 i polimorfizm dwóch alleli PstI dla sondy pMC5.61. Genotypy 81 osobników określono za pomocą standardowych procedur hybrydyzacji typu Southern-blot na błonach nylonowych.5
Analiza sprzężeń
Analiza powiązań została przeprowadzona za pomocą pakietu oprogramowania LINKAGE.7 Ograniczona liczba osób z tej rodziny, które były dostępne do badania, nie gwarantowała formalnej analizy segregacji w celu wnioskowania o sposobie dziedziczenia. Przeciwnie, konsekwentna obserwacja dotkniętych członków przez pięć pokoleń doprowadziła nas do założenia, że tryb był autosomalny dominujący. Ponadto, ponieważ nie można było uzyskać adekwatnych informacji dotyczących rozmieszczenia polipów gruczolakowatych w zależności od wieku badanych z tego fenotypowo odrębnego pokolenia, przeprowadzono oddzielne analizy, w których przyjęliśmy niski poziom penetracji (0,5) lub ponownie sklasyfikowaliśmy wszystkie niedotknięte nieznanego statusu. Częstotliwość genu postulowanego allelu była zmienna w zakresie od 0,01 do 0,0001. Obliczenia do oszacowania ryzyka lub prawdopodobieństwa dziedziczenia zmutowanego allelu w locus APC zostały wygenerowane przez programy w LINKAGE; prawdopodobieństwa powyżej 0,95 uważano za wskazujące na obecność wadliwego genu w locus APC na chromosomie 5q, podczas gdy prawdopodobieństwa poniżej 0,05 uważano za wskazujące na dwa normalne homologi przypuszczalnego genu
[przypisy: przychodnia ciołka, ewa gawkowska instagram, stako słupsk ]